本書內容共包括五章：第一章基于宏基因組技術解析傳統(tǒng)發(fā)酵食品中乳酸菌的基因組多樣性，利用比較基因組學技術探究傳統(tǒng)發(fā)酵食品中優(yōu)勢乳酸菌的基因多樣性。第二章基于宏基因組技術解析腸道中乳酸菌的基因組多樣性，并利用比較基因組學技術評價腸道優(yōu)勢菌種的安全性。第三章介紹了實驗室適應性進化方法及其在微生物研究中的應用情況，并論述了益生乳酸菌在適宜營養(yǎng)條件和碳源限制條件下長期傳代過程中的適應性機制。第四章從基因組、轉錄組、蛋白組和代謝組水平詳細論述了抗生素環(huán)境中益生乳酸菌的適應性機制。第五章論述了益生乳酸菌在工業(yè)化生產過程中脅迫條件下的響應機制。