第一章益生菌概述001
第一節(jié)益生菌的分類004
一、益生菌及其相關(guān)種屬004
二、益生菌常用的種屬005
第二節(jié)益生菌的分離保存015
一、益生菌的分離015
二、益生菌的篩選016
三、益生菌的保存020
第三節(jié)益生菌分類鑒定的技術(shù)與方法022
一、用于細(xì)菌分類鑒定的特征022
二、生理生化試驗(yàn)方法022
三、化學(xué)分類特征的分析方法030
四、基于遺傳信息的分子生物學(xué)鑒定方法034
五、基因組時(shí)代的分類工具037
參考文獻(xiàn)039

第二章益生菌與腸道菌群043
第一節(jié)人類微生物組研究計(jì)劃044
一、 人類微生物組概述044
二、 人類微生物組計(jì)劃的啟動(dòng)044
三、 美國(guó)的人類微生物組計(jì)劃045
四、 其他國(guó)家的人類微生物組計(jì)劃進(jìn)展045
第二節(jié)腸道菌群的結(jié)構(gòu)047
一、人腸道菌群的結(jié)構(gòu)組成047
二、人體腸道核心菌群050
三、人體腸道菌群的建立：從出生到衰老052
四、腸道菌群中有重要生理意義的細(xì)菌053
五、人腸道菌群的功能055
第三節(jié)影響健康人腸道菌群結(jié)構(gòu)的因素058
一、宿主的基因型058
二、年齡因素058
三、飲食因素060
四、城鄉(xiāng)生活方式061
五、宿主的性別062
六、運(yùn)動(dòng)情況062
七、抗生素063
八、疾病063
第四節(jié)益生菌與胃腸道健康066
一、益生菌與胃腸道健康的關(guān)系067
二、益生菌治療各種胃腸道疾病的研究進(jìn)展068
三、益生菌促進(jìn)胃腸道健康的機(jī)制080
第五節(jié)腸道菌群結(jié)構(gòu)與功能的研究方法084
一、基于分離培養(yǎng)的方法085
二、培養(yǎng)組學(xué)085
三、分子生態(tài)學(xué)研究方法086
四、調(diào)節(jié)腸道微生物的疾病模型091
五、無菌動(dòng)物模型092
六、研究模型和案例093
參考文獻(xiàn)093

第三章益生菌主要代謝產(chǎn)物及其生理活性098
第一節(jié)短鏈脂肪酸（SCFA）098
一、SCFA的產(chǎn)生及影響因素098
二、SCFA的吸收101
三、SCFA的代謝101
四、SCFA的生理功能102
第二節(jié)胞外多糖（EPS）106
一、產(chǎn)EPS的菌株106
二、EPS的種類和結(jié)構(gòu)107
三、EPS的生物合成及遺傳調(diào)控110
四、EPS的發(fā)酵生產(chǎn)及分離純化115
五、EPS的結(jié)構(gòu)分析119
六、EPS的理化性質(zhì)123
七、EPS的生物活性124
第三節(jié)γ-氨基丁酸（GABA）130
一、GABA的結(jié)構(gòu)和理化性質(zhì)130
二、GABA的合成和轉(zhuǎn)化途徑130
三、GABA的生理作用136
四、GABA產(chǎn)品開發(fā)現(xiàn)狀137
第四節(jié)生物膜138
一、生物膜概述138
二、乳酸菌生物膜139
三、益生菌生物膜對(duì)口腔健康的影響146
參考文獻(xiàn)149

第四章益生菌的代謝154
第一節(jié)組學(xué)技術(shù)揭示的代謝研究 154
一、糖代謝154
二、脂質(zhì)的代謝157
三、蛋白質(zhì)水解系統(tǒng)159
四、檸檬酸代謝和芳香化合物的合成164
五、乳酸菌代謝的研究方法166
第二節(jié)轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng)的比較基因組分析171
一、通道形成蛋白172
二、主要易化超家族174
三、其他大型二級(jí)載體超家族177
四、ABC轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白178
五、重金屬轉(zhuǎn)運(yùn)載體181
六、原核生物中P型ATP酶182
七、原核生物特異性磷酸轉(zhuǎn)移酶系統(tǒng)（PTS）183
八、多藥耐藥泵185
九、營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白185
參考文獻(xiàn)186

第五章益生菌與免疫188
第一節(jié)免疫系統(tǒng)的組成及免疫應(yīng)答的主要類型189
一、免疫系統(tǒng)的組成189
二、免疫應(yīng)答的主要類型192
第二節(jié)益生菌的免疫調(diào)節(jié)作用194
一、益生菌對(duì)免疫系統(tǒng)的刺激作用194
二、益生菌發(fā)揮免疫調(diào)節(jié)作用的途徑202
三、益生菌的免疫調(diào)節(jié)作用具有菌株特異性205
四、益生菌免疫調(diào)節(jié)作用的應(yīng)用209
參考文獻(xiàn)210

第六章益生菌與高膽固醇血癥214
第一節(jié)高膽固醇血癥與益生菌降膽固醇機(jī)制215
一、高膽固醇血癥215
二、影響膽固醇水平的主要因素215
三、高膽固醇血癥的治療方法216
四、益生菌降膽固醇機(jī)制216
第二節(jié)膽鹽水解酶221
一、理化特性221
二、結(jié)構(gòu)特征223
三、基因分析224
四、進(jìn)化分析225
五、膽鹽耐受性225
六、BSH酶影響宿主代謝225
第三節(jié)降膽固醇益生菌的體外篩選與動(dòng)物實(shí)驗(yàn)226
一、降膽固醇益生菌的體外篩選226
二、益生菌降膽固醇的動(dòng)物實(shí)驗(yàn)228
第四節(jié)益生菌降膽固醇的臨床研究及應(yīng)用230
一、益生菌降膽固醇的臨床研究230
二、益生菌防治高膽固醇血癥的應(yīng)用231
三、益生菌降膽固醇活性的影響因素232
四、益生菌給藥新方法232
參考文獻(xiàn)234

第七章益生菌與糖尿病和肥胖236
第一節(jié)腸道微生物與糖尿病和肥胖236
一、腸道微生物與1型糖尿病236
二、腸道微生物與2型糖尿病238
三、腸道微生物與肥胖240
四、腸道微生物影響肥胖、糖尿病等代謝性綜合征的機(jī)制243
五、肥胖、糖尿病的綜合研究246
第二節(jié)益生菌用于糖尿病、肥胖的改善247
一、常見糖尿病、肥胖動(dòng)物模型247
二、益生菌對(duì)糖尿病的宿主葡萄糖內(nèi)穩(wěn)態(tài)的改善作用機(jī)制254
三、益生菌對(duì)宿主葡萄糖內(nèi)穩(wěn)態(tài)的改善作用的研究報(bào)道總結(jié)254
四、益生菌對(duì)糖尿病和體重（肥胖）的預(yù)防和控制舉例261
第三節(jié)相關(guān)因果機(jī)制研究及功能性益生菌的篩選265
一、相關(guān)因果機(jī)制研究的一般方法和原理265
二、功能性益生菌的篩選266
參考文獻(xiàn)266

第八章益生菌與衰老270
第一節(jié)衰老的概念、分類、表現(xiàn)以及研究意義270
一、衰老的概念270
二、衰老的類型270
三、衰老的表現(xiàn)271
四、關(guān)于衰老及延緩衰老的研究意義273
第二節(jié)腸道微生物與宿主機(jī)體衰老274
一、腸道微生物角度274
二、“大腦�材c道�参⑸�物”相互作用角度277
第三節(jié)益生菌對(duì)宿主機(jī)體衰老的延緩作用283
一、延長(zhǎng)機(jī)體壽命284
二、調(diào)節(jié)腸道微生態(tài)平衡285
三、抗氧化與抗重金屬毒性285
第四節(jié)益生菌對(duì)宿主認(rèn)知和情緒障礙的改善作用286
一、改善認(rèn)知、情緒、記憶286
二、預(yù)防神經(jīng)退行性疾�。�腦�材c軸）287
第五節(jié)功能性益生菌的預(yù)篩選291
一、延緩衰老作用的益生菌體外預(yù)篩選291
二、調(diào)節(jié)免疫、護(hù)膚抗皺、抑制/預(yù)防腫瘤等作用的益生菌體外預(yù)篩選292
三、調(diào)節(jié)血壓、血脂、血糖作用的益生菌體外預(yù)篩選293
四、精準(zhǔn)益生菌篩選策略293
參考文獻(xiàn)294

第九章益生菌與口腔及皮膚健康298
第一節(jié)益生菌與口腔健康298
一 、人口腔菌群概況298
二、菌群相關(guān)的口腔健康問題299
三、益生菌與口腔菌群及健康304
第二節(jié)益生菌與皮膚健康305
一、人體皮膚菌群概況305
二、菌群相關(guān)的皮膚健康問題305
三、益生菌與皮膚菌群308
參考文獻(xiàn)309