我國(guó)的高等教育撥款制度是指政府向高等院校撥付供其發(fā)展的資金的制度安排，其伴隨著我國(guó)經(jīng)濟(jì)體制、教育體制和財(cái)政體制的改革而不斷改進(jìn)。

高等教育經(jīng)費(fèi)的撥付方式通常情況下可以分為兩種：一種是直接撥款方式，一種是間接撥款方式。

高等教育撥款制度作為一個(gè)制度系統(tǒng)，至少應(yīng)當(dāng)包含體制、機(jī)制、模式三個(gè)方面的要素。

目前，我國(guó)的高等教育撥款制度主要實(shí)行的是政府直接面對(duì)高等院校的二元結(jié)構(gòu)下的分級(jí)撥款體制、投入型的撥款機(jī)制以及“基本支出預(yù)算加項(xiàng)目支出預(yù)算”的撥款模式。

但根據(jù)《統(tǒng)籌推進(jìn)世界一流大學(xué)和一流學(xué)科建設(shè)總體方案》的規(guī)定，我國(guó)高等教育撥款制度呈現(xiàn)出一種趨勢(shì)：第三方參與評(píng)價(jià)體制下以績(jī)效撥款模式為主的產(chǎn)出型撥款機(jī)制三要素相協(xié)調(diào)的制度設(shè)計(jì)。