本書內(nèi)容廣泛,包括了蛋白質(zhì)內(nèi)容及周圍的基本相互作用、多肽鏈的二級結(jié)構(gòu)、蛋白質(zhì)的三級結(jié)構(gòu)、蛋白質(zhì)中的協(xié)同轉(zhuǎn)變(變性與折疊)、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測與設(shè)計以及蛋白質(zhì)功能的物理基礎(chǔ)等幾個部分。其主旨是闡述蛋白質(zhì)物理學(xué)的理論研究,即以物理學(xué)(特別是統(tǒng)計物理和熱力學(xué))的觀點和方法來研究與蛋白質(zhì)相關(guān)的物理學(xué)問題。本書循序漸進,深入淺出,以簡明易懂的語言和簡繁適當(dāng)?shù)臄?shù)學(xué)估算對蛋白質(zhì)相關(guān)的基礎(chǔ)物理問題進行介紹,得出令人信服的結(jié)論。本書出版后被譯為英文,在美、英、德等國多所大學(xué)采用為相關(guān)課程的教材。
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本書是《海洋微生物學(xué)》(2007年)的新版。作為“十一五”國家重點規(guī)劃圖書,該書的第1版得到了廣大同行和青年學(xué)生的厚愛,已成為廣大高等院校和科研院所的首本“海洋微生物學(xué)”教材。目前,海洋微生物學(xué)已成為現(xiàn)代科學(xué)最重要的領(lǐng)域之一。近些年來,新方法和新技術(shù)在海洋領(lǐng)域的應(yīng)用,進…+步推動了海洋微生物學(xué)科的迅速發(fā)展。為了緊隨海洋微生物學(xué)快速發(fā)展的步伐,有必要對原有教材進行修訂和提高。自《海洋微生物學(xué)》第1版出版以來,作者就開始對其中的內(nèi)容進行更新和訂正。經(jīng)過8年多持續(xù)不斷地修訂,終于迎來了《海洋微生物學(xué)》第二版的面世。
《海洋微生物學(xué)》第二版在第1版的基礎(chǔ)上,吸取各方面意見,主要在以6F幾個方面進行了修訂。
(1)更新內(nèi)容。海洋微生物學(xué)是一門發(fā)展極為迅速的前沿學(xué)科。第二版除新增了“第7章深海和極地海洋微生物”和“第16章現(xiàn)代生物技術(shù)在海洋微生物研究中的應(yīng)用”兩個章節(jié)外,還參考國內(nèi)外新文獻和書籍并結(jié)合科研團隊的研究成果對其他14個章節(jié)的內(nèi)容進行了大幅度更新,增加了海洋微生物學(xué)領(lǐng)域的前沿技術(shù)和新研究成果。
。2)增加插圖和復(fù)習(xí)題。圖片由原來的69幅,增加到176幅,其中重要圖片特別制成彩插附于書后.其他圖片可以通過使用手機掃描封底二維碼看到彩色版本,利于讀者對許多典型實驗現(xiàn)象的理解,使課本更加生動、有趣。此外,每一1章之后增加了復(fù)習(xí)題,便于學(xué)生對所學(xué)內(nèi)容進行復(fù)習(xí)鞏固。
(3)增強實踐性。本書增加了實驗操作內(nèi)容,如“第14章海洋微生物的分離與培養(yǎng)技術(shù)”增加了海洋微生物分離培養(yǎng)的新方法及詳細(xì)步驟,“第15章海洋細(xì)菌的分類與鑒定技術(shù)”全面闡明了海洋新菌分類和鑒定的詳細(xì)過程及基本步驟。
。4)突出概念并提高可讀性。針對在第1版教材使用過程中學(xué)生提出的建議,對教材中的概念進行了理順,使概念更加突出。此外,書中語言的錘煉也從作者、審閱者、海洋微生物的初學(xué)者多個層面反復(fù)修改,力求增加可讀性。
。5)專家逐章審閱。由于本教材為綜合性教材,而每位專家所熟悉的領(lǐng)域不同,因此編者聘請各個研究方向的專家對書寫內(nèi)容逐章審閱,嚴(yán)格把關(guān)。
全書共分16章,第1章為海洋微生物學(xué)概論;第2~6章講述海洋微生物的形態(tài)、結(jié)構(gòu)及特性,包括海洋細(xì)菌、海洋古菌、海洋真核微生物和海洋病毒;第7章講述深海和極地海洋微生物;第8章講述海洋微生物在海洋生態(tài)系統(tǒng)中的作用;第9章講述海洋環(huán)境中活的非可培養(yǎng)(VBNC)狀態(tài)細(xì)菌;第10章講述魚類的微生物病害;第11章講述海洋微生物的開發(fā)利用;第12~16章講述海洋微生物的研究技術(shù),包括海洋微生物的采樣技術(shù)、海洋微生物的多樣性研究技術(shù)、海洋微生物的分離與培養(yǎng)技術(shù)、海洋細(xì)菌的分類與鑒定技術(shù),以及現(xiàn)代生物技術(shù)在海洋微生物研究中的應(yīng)用。
本書初稿完成后,承蒙濰坊醫(yī)學(xué)院趙乃昕教授(第1章、第3章、第15章)、中國科學(xué)院海洋研究所肖天研究員(第2章、第8章)、國家海洋局第三海洋研究所邵宗澤研究員(第3章)、國家海洋局第二海洋研究所許學(xué)偉研究員(第3章、第12章、第15章)、上海交通大學(xué)王風(fēng)平教授(第4章)、同濟大學(xué)張傳倫教授(第4章)、天津科技大學(xué)孫軍教授(第5章)、臺灣海洋大學(xué)彭家禮教授(第5章)、中國海洋大學(xué)姜勇副教授(第5章)、中國海洋大學(xué)汪岷教授(第6章)、中國水產(chǎn)科學(xué)院黃海水產(chǎn)研究所史成銀研究員(第6章)、中國水產(chǎn)科學(xué)院黃海水產(chǎn)研究所梁艷副研究員(第6章)、中國極地研究中心俞勇副研究員(第7章)、廈門大學(xué)張瑤教授(第8章)、蘭州理工大學(xué)陳吉祥教授(第9章)、中國水產(chǎn)科學(xué)院黃海水產(chǎn)研究所莫照蘭研究員(第10章)、中國海洋大學(xué)牟海津教授(第11章)、國家海洋局第1海洋研究所曲凌云研究員(第11章)、中國水產(chǎn)科學(xué)院黃海水產(chǎn)研究所李秋芬研究員(第13章)、山東大學(xué)威海分校杜宗軍教授(第14章)、山東大學(xué)張熙穎副教授(第14章)、國家海洋局第三海洋研究所賴其良副研究員(第15章)、寧波大學(xué)張德民教授(第16章)給予審閱;在編寫過程中還得到了國內(nèi)外許多同仁的熱心幫助,對他們的熱心幫助深表謝意。
本書的部分研究內(nèi)容和成果得到了國家自然科學(xué)基金項目(41276141、41476112和41521064)、科技部國際科技合作重點項目(2012DFG31990)、國家863計劃項目(2012AA092103)、國家973計劃項目(2013CB429700)和中國大洋協(xié)會國際海域資源調(diào)查與開發(fā)項目(DY125-15-R-03)的資助,本書的出版還獲得了中國海洋大學(xué)教材出版基金的資助,編者在此‘并表示誠摯的感謝。
近些年來,海洋微生物學(xué)發(fā)展非常迅速,新知識、新技術(shù)和新方法不斷出現(xiàn),所涉及n勺內(nèi)容存在多學(xué)科交叉問題。限于我們的知識和水平,書中不當(dāng)之處在所難免,懇請讀者和同行專家提出寶貴意見。
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目錄
第1章海洋微生物學(xué)概論1
1.1海洋微生物及其研究意義1
1.2海洋微生物學(xué)的發(fā)展歷程2
1.3海洋微生物的主要類群7
1.4海洋微生物的主要特征10
1.5海洋微生物的棲息環(huán)境18
主要參考文獻27
復(fù)習(xí)思考題27
第2章海洋原核生物的結(jié)構(gòu)及特性29
2.1海洋原核細(xì)胞的形態(tài)結(jié)構(gòu)29
2.2海洋原核生物的營養(yǎng)及生長47
2.3海洋原核生物的能量產(chǎn)生過程51
2.4海洋細(xì)菌的密度感應(yīng)和生物被膜58
2.5海洋原核生物的基因組學(xué)63
主要參考文獻64
復(fù)習(xí)思考題64
第3章海洋細(xì)菌65
3.1細(xì)菌分類系統(tǒng)65
3.2海洋細(xì)菌的主要類群67
3.3產(chǎn)液菌門、熱袍菌門和異常球菌-棲熱菌門70
3.4綠彎菌門、硝化螺菌門和鐵還原桿菌門72
3.5藍(lán)細(xì)菌門和綠菌門74
3.6變形菌門78
3.7厚壁菌門和放線菌門97
3.8浮霉菌門、螺旋體門和酸桿菌門100
3.9擬桿菌門、疣微菌門、芽單胞菌門和黏膠球形菌門102
主要參考文獻105
復(fù)習(xí)思考題106
第4章海洋古菌108
4.1古菌的分類系統(tǒng)108
4.2廣域古菌門110
4.3泉生古菌門117
4.4奇古菌門119
4.5初生古菌門121
4.6納米古菌門122
4.7其他古菌門類123
4.8古菌細(xì)胞膜脂及應(yīng)用123
主要參考文獻125
復(fù)習(xí)思考題126
第5章海洋真核微生物128
5.1真核微生物概述128
5.2原生動物130
5.3真核微藻133
5.4海洋真菌138
主要參考文獻142
復(fù)習(xí)思考題143
第6章海洋病毒144
6.1海洋病毒的計數(shù)及形態(tài)觀察145
6.2海洋病毒的產(chǎn)生和消亡149
6.3海洋病毒的多樣性151
6.4海洋病毒對生物地球化學(xué)循環(huán)的影響153
6.5感染海洋生物的病毒154
主要參考文獻161
復(fù)習(xí)思考題162
第7章深海和極地海洋微生物163
7.1深海微生物163
7.2極地微生物182
7.3海洋微生物的環(huán)境適應(yīng)機制185
主要參考文獻192
復(fù)習(xí)思考題193
第8章海洋微生物在生態(tài)系統(tǒng)中的作用194
8.1海洋食物網(wǎng)中的微食物環(huán)194
8.2海洋微生物在生物地球化學(xué)循環(huán)中的作用203
8.3海洋中微生物動態(tài)變化的控制因素221
8.4海洋微生物與環(huán)境變化224
主要參考文獻226
復(fù)習(xí)思考題227
第9章海洋環(huán)境中活的非可培養(yǎng)(VBNC)狀態(tài)細(xì)菌228
9.1VBNC狀態(tài)細(xì)菌的發(fā)現(xiàn)及主要細(xì)菌類群228
9.2誘導(dǎo)細(xì)菌進入VBNC狀態(tài)的環(huán)境因素232
9.3VBNC狀態(tài)細(xì)菌的檢測方法235
9.4VBNC狀態(tài)細(xì)菌的生物學(xué)特性238
9.5細(xì)菌進入VBNC狀態(tài)的內(nèi)在機制241
9.6VBNC狀態(tài)細(xì)菌的復(fù)蘇研究242
9.7對細(xì)菌VBNC狀態(tài)概念的爭議248
9.8細(xì)菌VBNC狀態(tài)的理論及實際意義248
主要參考文獻252
復(fù)習(xí)思考題252
第10章魚類的微生物病害254
10.1病害診斷255
10.2細(xì)菌性傳染病255
10.3魚類傳染性病害的控制269
主要參考文獻285
復(fù)習(xí)思考題286
第11章海洋微生物的開發(fā)利用287
11.1有益菌在海水養(yǎng)殖中的應(yīng)用288
11.2海洋微生物產(chǎn)生的活性物質(zhì)301
11.3海洋微生物的環(huán)境修復(fù)312
11.4海洋微生物與生物附著315
11.5海洋微生物的污損和防護318
11.6金屬的微生物腐蝕及防護321
11.7微生物對木材的腐損及防護.324
11.8海洋微生物的其他應(yīng)用324
主要參考文獻325
復(fù)習(xí)思考題326
第12章海洋微生物的采樣技術(shù)327
12.1水樣的采集327
12.2泥樣的采集333
12.3檢樣的儲存337
12.4海洋調(diào)查船338
主要參考文獻340
復(fù)習(xí)思考題340
第13章海洋微生物的多樣性研究技術(shù)341
13.1顯微鏡鏡檢計數(shù)法341
13.2培養(yǎng)計數(shù)法347
13.3流式細(xì)胞術(shù)350
13.4免疫學(xué)檢測法352
13.5基于PCR的分子生態(tài)技術(shù)354
13.6熒光原位雜交技術(shù)362
13.7環(huán)境微生物組學(xué)技術(shù)363
13.8其他分子生物學(xué)技術(shù)365
主要參考文獻366
復(fù)習(xí)思考題367
第14章海洋微生物的分離與培養(yǎng)技術(shù)368
14.1海洋異養(yǎng)細(xì)菌分離與培養(yǎng)的基礎(chǔ)方法368
14.2特殊海洋異養(yǎng)細(xì)菌的分離培養(yǎng)373
14.3海洋化能自養(yǎng)菌的分離與培養(yǎng)381
14.4海洋光能營養(yǎng)菌的分離與培養(yǎng)385
14.5海洋古菌的分離與培養(yǎng)388
14.6海洋真菌的分離與培養(yǎng)392
14.7其他常見海洋微生物培養(yǎng)基配方393
14.8海洋微生物培養(yǎng)新技術(shù)396
14.9海洋微生物的保存方法400
主要參考文獻403
復(fù)習(xí)思考題404
第15章海洋細(xì)菌的分類與鑒定技術(shù)405
15.1海洋細(xì)菌分類與鑒定的基本流程405
15.2形態(tài)特征分析方法406
15.3生理生化特征分析方法408
15.4化學(xué)特征分析方法417
15.5海洋細(xì)菌基因特征分析方法418
15.6細(xì)菌快速鑒定系統(tǒng)423
15.7海洋細(xì)菌新分類單元的命名及發(fā)表424
15.8展望425
主要參考文獻425
復(fù)習(xí)思考題426
第16章現(xiàn)代生物技術(shù)在海洋微生物研究中的應(yīng)用427
16.1轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)及其應(yīng)用427
16.2蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)及其應(yīng)用429
16.3代謝組學(xué)技術(shù)及其應(yīng)用430
16.4基因工程技術(shù)及應(yīng)用431
16.5基因芯片技術(shù)及應(yīng)用432
16.6基因敲除技術(shù)及應(yīng)用434
16.7合成生物學(xué)技術(shù)及應(yīng)用435
16.8基因調(diào)控技術(shù)及應(yīng)用439
16.9蛋白質(zhì)定向進化技術(shù)及應(yīng)用442
主要參考文獻444
復(fù)習(xí)思考題445
名詞索引447
微生物中文名索引454
微生物拉丁名索引460
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