第一章緒論
獸醫(yī)流行病學(xué)起源于醫(yī)學(xué)流行病學(xué)，二者基本原理相通，但蘊(yùn)涵著相對(duì)獨(dú)立的特征和規(guī)律，前者研究的動(dòng)物群體規(guī)模遠(yuǎn)遠(yuǎn)大于人群，并與人群不同程度地有機(jī)交融，與醫(yī)學(xué)流行病學(xué)形成了不可分割的整體，相互影響、相互制約、相互聯(lián)系而又相互獨(dú)立。獸醫(yī)流行病學(xué)將生命群體作為研究對(duì)象，既研究動(dòng)物群體的社會(huì)屬性，又研究動(dòng)物群體的自然屬性。動(dòng)物群體涉及寵物、生產(chǎn)動(dòng)物、野生動(dòng)物、觀賞動(dòng)物等群體，包括陸生動(dòng)物群體、水生動(dòng)物群體、飛行動(dòng)物群體（如媒介昆蟲、鳥類和蝙蝠等）。盡管獸醫(yī)流行病學(xué)在臨床方面與醫(yī)學(xué)流行病學(xué)非常相似，但獸醫(yī)流行病學(xué)的研究領(lǐng)域顯示出豐富多彩的生態(tài)學(xué)特點(diǎn)，表現(xiàn)出顯著的群體多樣性和研究?jī)?nèi)容的廣泛性。
第一節(jié)獸醫(yī)流行病學(xué)簡(jiǎn)介
許多現(xiàn)有疾病問(wèn)題可以借助動(dòng)物群體調(diào)查得到解決。傳染性疾病的自然史能夠通過(guò)研究不同群體的分布加以闡明，對(duì)群體中傳染性和非傳染性疾病發(fā)生程度的度量有助于確定它們的重要性和防控策略的有效性，通過(guò)研究各種動(dòng)物組群可以查明疾病的復(fù)合性病因與未知病因，在群體水平上評(píng)估與動(dòng)物生產(chǎn)性能降低有關(guān)的疾病效應(yīng)，評(píng)價(jià)疾病及其控制措施的經(jīng)濟(jì)學(xué)影響，其范圍可以從單個(gè)養(yǎng)殖戶到全國(guó)的養(yǎng)殖場(chǎng)。疾病的群體調(diào)查構(gòu)成了流行病學(xué)研究的基礎(chǔ)。
獸醫(yī)流行病學(xué)還包括其他與健康相關(guān)事件的調(diào)查和評(píng)估，特別是生產(chǎn)性能。所有這些調(diào)查包含對(duì)動(dòng)物群體的觀察和對(duì)觀察的推論。
一、獸醫(yī)流行病學(xué)的定義
獸醫(yī)流行病學(xué)是一門在動(dòng)物群體中描述疾病和健康的分布（疾病發(fā)生的性質(zhì)、地點(diǎn)、時(shí)間和程度）與疾病流行決定因素（疾病原因）調(diào)查的學(xué)科。
對(duì)于動(dòng)物群體中的疾病、生產(chǎn)力和動(dòng)物福利的調(diào)查處理，獸醫(yī)流行病學(xué)被用來(lái)描述不同因素或決定因素的相互作用，說(shuō)明操縱這些決定因素對(duì)疾病發(fā)病率、病因、生產(chǎn)性能、福利等產(chǎn)生的影響，這些信息還被用于控制決定因素，以減少發(fā)病。
獸醫(yī)流行病學(xué)可以分為不同的組成成分（圖1-1）。其不可或缺的基礎(chǔ)之一是資料，通過(guò)定性或定量方法對(duì)其加以分析，闡述因果假設(shè)。作為流行病學(xué)分析中定量方法的一部分，流行病學(xué)調(diào)查研究的實(shí)施和流行病學(xué)問(wèn)題的模型開發(fā)涉及現(xiàn)場(chǎng)研究或調(diào)查。其最終目標(biāo)是控制疾病問(wèn)題、減少生產(chǎn)力損失和改善動(dòng)物福利。在動(dòng)物疾病控制的過(guò)程中，獸醫(yī)流行病學(xué)早已在獸醫(yī)實(shí)踐中得到了潛移默化地應(yīng)用。
圖1-1獸醫(yī)流行病學(xué)的構(gòu)成
大多數(shù)流行病學(xué)調(diào)查的基礎(chǔ)是隨機(jī)假設(shè)某種疾病不會(huì)發(fā)生，因?yàn)檎{(diào)查的主要目標(biāo)之一是要從潛在的風(fēng)險(xiǎn)因素和導(dǎo)致疾病或生產(chǎn)力損失結(jié)果之間找出因果關(guān)系。這兩種類型的損失均假定為受多重潛在因素的影響。流行病學(xué)調(diào)查的重點(diǎn)不僅在一般群體和疾病上，也在因果關(guān)系上。在此背景下，疾病發(fā)生的空間分布與時(shí)間分布一樣重要，所以必須進(jìn)行群體參數(shù)的調(diào)查，包括群體健康狀況及其相關(guān)因素，如生育力、繁殖力、動(dòng)物的移動(dòng)（移入和移出群體）等。
這些參數(shù)不僅影響群體的數(shù)量，而且影響群體的免疫力和基本特征，如年齡結(jié)構(gòu)。群體內(nèi)部的疾病要考慮個(gè)體所處的狀態(tài)，如死亡、臨床或亞臨床疾病及健康等。在個(gè)體中，疾病被定義為身體功能或形態(tài)不符合期望的狀態(tài)。在群體中，圖1-2疾病的冰山概念（Bonita et al ，2006）疾病體現(xiàn)為生產(chǎn)力低下或缺乏生存質(zhì)量。
不同群體中傳染病的表現(xiàn)存在定量的差異，被描述和比喻為“冰山”（圖1-2）。暴露于感染因子的動(dòng)物大多不受感染，這些動(dòng)物（群體）代表冰山的基礎(chǔ)部分。它們?cè)谖磥?lái)可能容易受到感染或因曾經(jīng)暴露于感染因子而產(chǎn)生免疫力。向上一層的動(dòng)物（群體）可能受到感染，但還沒(méi)有出現(xiàn)臨床癥狀。這組動(dòng)物可能始終保持這種狀態(tài)，或處在某個(gè)階段時(shí)，根據(jù)不同的影響因素出現(xiàn)相應(yīng)的臨床癥狀，如環(huán)境壓力因素。冰山的上部包括具有不同臨床表現(xiàn)的動(dòng)物群體。這些不同動(dòng)物群體內(nèi)部傳染的能力，是傳染病流行的一個(gè)非常重要的因素。
二、獸醫(yī)流行病學(xué)調(diào)查的階段性
（1）初步診斷階段，確認(rèn)疾病的存在。
（2）描述階段，描述高風(fēng)險(xiǎn)群體中疾病分布和疾病發(fā)生的決定性因素，就其對(duì)有關(guān)疾病發(fā)生頻率的影響、在風(fēng)險(xiǎn)群體中這種疾病的發(fā)生情況形成一系列的假設(shè)。
（3）調(diào)查階段，通常通過(guò)一系列設(shè)計(jì)性研究對(duì)這些假設(shè)進(jìn)行驗(yàn)證。
（4）檢驗(yàn)階段，檢驗(yàn)是在受控條件下對(duì)這些假設(shè)進(jìn)行更詳細(xì)的檢測(cè)，是對(duì)調(diào)查階段結(jié)果的可行性證明。
（5）分析階段，對(duì)上述調(diào)查結(jié)果進(jìn)行分析，通常使用疾病的流行病學(xué)模型。該階段要確定是否缺少有關(guān)疾病進(jìn)程中的任何重要信息。
（6）干預(yù)階段，即選擇適當(dāng)?shù)姆椒�控制疾病研究的�?shí)驗(yàn)條件。疾病過(guò)程中的干預(yù)是通過(guò)操縱現(xiàn)有的決定因素，或引入新的影響因素完成的。
（7）決策階段，疾病流行病學(xué)知識(shí)用來(lái)研究各種控制措施的效果和成本，并與生產(chǎn)者的利益相結(jié)合，在提高生產(chǎn)力方面形成最優(yōu)控制策略，降低疾病的發(fā)生和風(fēng)險(xiǎn)動(dòng)物數(shù)量。這往往涉及建模。
（8）監(jiān)測(cè)階段，即對(duì)疾病控制措施的監(jiān)測(cè)，以確保措施運(yùn)用得當(dāng)，實(shí)現(xiàn)預(yù)期的效果，減少疾病的發(fā)病率，并通過(guò)迅速檢測(cè)消除和減少正在發(fā)展的有可能危害控制計(jì)劃的疾病發(fā)生。
第二節(jié)獸醫(yī)流行病學(xué)的歷史背景和必要性
縱觀歷史，傳染病控制的流行病學(xué)手段包括改善衛(wèi)生條件、避免接觸傳染源與病原體（隔離、封鎖、消毒、撲殺等）。滅菌和消毒的方法在很大程度上改善了衛(wèi)生條件，但直至今天，避免接觸（隔離或封鎖）仍然是一個(gè)防止傳染的好方法。例如，2003年，我國(guó)在控制SARS時(shí)采用隔離治療患者，并通過(guò)紅外測(cè)溫篩檢疑似病例加以隔離的方法，成功地在全國(guó)迅速平息了SARS的流行。目前，接種疫苗已廣泛成為防止嚴(yán)重傳染病發(fā)生，并借此途徑消滅傳染病的一個(gè)主要生物學(xué)方法，被認(rèn)為是一項(xiàng)重大成就，如接種牛痘疫苗對(duì)消滅天花的貢獻(xiàn)。但是單純應(yīng)用接種疫苗并不能徹底解決所有重要傳染病的控制問(wèn)題，要強(qiáng)調(diào)在一定范圍，尤其是在世界范圍實(shí)現(xiàn)某種或某些傳染病的根除，需要接種疫苗與流行病學(xué)手段的相互配合。例如，美國(guó)1963年開始的消滅豬瘟計(jì)劃。首先是立法階段，然后通過(guò)疫苗接種、隔離、封鎖和限制豬群及豬的流動(dòng)等減少發(fā)病和流行，通過(guò)感染豬群的全群撲殺消除傳染源；其次是保護(hù)抵抗再感染階段，該階段是整個(gè)消滅計(jì)劃最為艱難的階段，需要不斷利用便于大群操作和敏感而特異的檢驗(yàn)方法剔除非典型和不明顯的豬瘟病毒感染。美國(guó)直至1978年才消滅豬瘟，耗時(shí)15年。可見(jiàn)其中流行病學(xué)手段的不可或缺。對(duì)于已經(jīng)消滅的傳染病的病原體，是否應(yīng)在實(shí)驗(yàn)室內(nèi)存儲(chǔ)仍然存在爭(zhēng)議，一方面認(rèn)為存儲(chǔ)這類病原體是為了保證消滅的疫病再次出現(xiàn)時(shí)能快速生產(chǎn)疫苗；另一方面認(rèn)為保存這類病原體會(huì)帶來(lái)其泄漏的風(fēng)險(xiǎn)，導(dǎo)致已消滅傳染病的再現(xiàn)。在多數(shù)傳染病不能實(shí)現(xiàn)根除時(shí)，還需要不斷警惕那些反復(fù)出現(xiàn)和持續(xù)感染的傳染病，因?yàn)閭魅静〔≡�體的感染與維持具有生態(tài)學(xué)意義，需要從流行病學(xué)角度去深入認(rèn)識(shí)才能不斷減少感染與發(fā)病。
在過(guò)去的幾十年，獸醫(yī)行業(yè)不僅在群體動(dòng)物水平上防控疾病面臨著一系列挑戰(zhàn)，而且在個(gè)體動(dòng)物水平，尤其是臨床實(shí)踐上也面臨挑戰(zhàn)。為了畜主和公眾的利益，診治動(dòng)物的手段和精確性提高促成了以流行病學(xué)為基礎(chǔ)的循證獸醫(yī)學(xué)在西方出現(xiàn)，其重要性現(xiàn)在已經(jīng)得到充分認(rèn)識(shí)，并促使循證獸醫(yī)學(xué)的迅速發(fā)展。在群體水平出現(xiàn)的問(wèn)題也帶來(lái)了困擾。例如，原本是傳統(tǒng)疾病的牛結(jié)核在一些背景下重新出現(xiàn)，帶來(lái)了諸多的公共衛(wèi)生問(wèn)題。藍(lán)舌病本身是一種地理限定性疾病，但隨著全球氣候變暖，藍(lán)舌病在歐洲許多國(guó)家相繼暴發(fā)，且分布范圍不斷擴(kuò)大，出現(xiàn)緯度北移現(xiàn)象。一般認(rèn)為，該病毒的分布范圍在40°N～35°S，這剛好是傳播媒介——庫(kù)蠓某些種的分布地域，但在美國(guó)，該病的分布范圍可以一直擴(kuò)展至50°N附近。最近的研究顯示，病毒也可以通過(guò)初乳感染新生牛，病毒在食肉動(dòng)物之間可以經(jīng)口傳播，通過(guò)弱毒疫苗散毒也是一種重要的病毒傳播方式。例如，牛傳染性海綿狀腦�。˙SE）在被認(rèn)識(shí)之前就已經(jīng)擴(kuò)散到許多國(guó)家。與之相對(duì)應(yīng)，社會(huì)發(fā)展到今天，人們對(duì)食品安全和動(dòng)物福利標(biāo)準(zhǔn)有更高的期待。然而，即使忽略疾病控制時(shí)間和成本，根除疾病也幾乎不可能完成。
流行病學(xué)調(diào)查表明，動(dòng)物疾病可以在小規(guī)模的基礎(chǔ)上被消滅而得到控制，即存在建立一個(gè)在嚴(yán)格措施下無(wú)感染畜群或地區(qū)的可能性，之后還必須采取嚴(yán)格的后續(xù)控制措施避免群體或地區(qū)的感染，這就必須依賴于良好的監(jiān)測(cè)工作。因此，監(jiān)測(cè)程序的發(fā)展和評(píng)價(jià)已經(jīng)成為新的獸醫(yī)流行病學(xué)工具。
家畜及其產(chǎn)品的貿(mào)易限制對(duì)流行病學(xué)和來(lái)自監(jiān)測(cè)程序的統(tǒng)計(jì)論據(jù)的嚴(yán)重依賴性，使獸醫(yī)流行病學(xué)在世界各地的動(dòng)物及其產(chǎn)品貿(mào)易中發(fā)揮著重大作用。
第三節(jié)獸醫(yī)流行病學(xué)與其他學(xué)科的關(guān)系
獸醫(yī)流行病學(xué)的研究?jī)?nèi)容不僅包括各種動(dòng)物群體的傳染性疾病控制，還包括非傳染性疾病控制及動(dòng)物的健康問(wèn)題。它涉及的學(xué)科范圍十分廣泛，從基礎(chǔ)學(xué)科到應(yīng)用學(xué)科，從航天航空到細(xì)胞分子，包括數(shù)學(xué)、計(jì)算生物學(xué)、進(jìn)化生物學(xué)、生態(tài)學(xué)、群體生物學(xué)、微生物學(xué)、遺傳學(xué)、細(xì)胞生物學(xué)、分子生物學(xué)、免疫學(xué)、生物統(tǒng)計(jì)學(xué)、化學(xué)、獸醫(yī)學(xué)、畜牧科學(xué)、野生動(dòng)植物生物學(xué)、農(nóng)業(yè)科學(xué)、物理學(xué)、大氣科學(xué)、海洋學(xué)、工程、城市規(guī)劃、教育、執(zhí)法、通訊技術(shù)、媒體、臨床護(hù)理和公共衛(wèi)生政策等。其中，有些學(xué)科與獸醫(yī)流行病學(xué)已經(jīng)有了長(zhǎng)期的合作并共同得到發(fā)展，但與其他一些學(xué)科幾乎彼此忽略，相互的聯(lián)系與合作甚少。流行病學(xué)可能是所有生物醫(yī)學(xué)科學(xué)中的公共學(xué)科，沒(méi)有任何其他的生物醫(yī)學(xué)科學(xué)分支與人類和動(dòng)物活動(dòng)有如此廣泛的聯(lián)系。
第四節(jié)獸醫(yī)流行病學(xué)的應(yīng)用
獸醫(yī)流行病學(xué)獲取一個(gè)動(dòng)物群體中不同發(fā)病水平所表現(xiàn)的個(gè)體特征，主要通過(guò)詢問(wèn)、調(diào)查、監(jiān)測(cè)等方法，發(fā)現(xiàn)那些在高頻發(fā)病動(dòng)物群體中存在而低頻發(fā)病動(dòng)物群體中不存在的問(wèn)題，進(jìn)一步確定影響疾病的風(fēng)險(xiǎn)因素。
在疾病管理上，獸醫(yī)流行病學(xué)和臨床方法存在區(qū)別。流行病學(xué)通過(guò)已經(jīng)確定的疾病風(fēng)險(xiǎn)因素，針對(duì)性采取措施減少群體對(duì)這些風(fēng)險(xiǎn)因素的暴露，降低動(dòng)物群體（及人群）發(fā)病的可能性，從而可以在不知道確切發(fā)病機(jī)制（或病因）的情況下，使疾病及時(shí)得到控制。相比之下，臨床方法主要針對(duì)個(gè)體動(dòng)物，其目的在于診斷疾病并加以治療。通過(guò)體檢產(chǎn)生一個(gè)鑒別診斷列表，實(shí)驗(yàn)室檢驗(yàn)和治療反饋可逐步縮小診斷范圍直至單一診斷。
疾病在動(dòng)物群體（及人群）中不是隨機(jī)分布的，而是表現(xiàn)出一定的時(shí)間、地區(qū)和群體（社會(huì)性）的分布特征，這種分布上的差異與動(dòng)物宿主所暴露的風(fēng)險(xiǎn)因素的強(qiáng)弱、環(huán)境因素和群體內(nèi)部個(gè)體的易感性有關(guān)。研究病因時(shí)，要充分考慮個(gè)體的內(nèi)環(huán)境因素及其所處自然和社會(huì)的外環(huán)境因素，即疾病的多因性�，F(xiàn)代獸醫(yī)流行病學(xué)已經(jīng)超越了以動(dòng)物傳染病為主要研究?jī)?nèi)容的傳統(tǒng)范疇，而更多地要考慮動(dòng)物各種非傳染性疾病分布的相關(guān)性。一、流行病學(xué)的研究目的
（1）描述健康和疾病問(wèn)題在群體中的分布和程度。
（2）找出疾病發(fā)病機(jī)制中的致病因素（風(fēng)險(xiǎn)因素）。
（3）為防控和治療疾病提供數(shù)據(jù)、必要的規(guī)劃、實(shí)施和評(píng)價(jià)服務(wù)，并確立優(yōu)先的服務(wù)內(nèi)容。
流行病學(xué)研究的最終目的是消除或減少生物群體的健康問(wèn)題，從自然和社會(huì)整體促進(jìn)人群和動(dòng)物群體的健康。
二、獸醫(yī)流行病學(xué)的應(yīng)用
（1）已知病因疾病來(lái)源的確定。許多已知病因的疾病可以通過(guò)對(duì)患病動(dòng)物的表現(xiàn)確診，或通過(guò)適當(dāng)?shù)膶?shí)驗(yàn)室檢查和其他臨床程序確診。例如，一組犢牛沙門氏菌診斷相對(duì)簡(jiǎn)單（經(jīng)常感染產(chǎn)生明顯的臨床癥狀），然而，要確定暴發(fā)的原因并使用正確的方法防止復(fù)發(fā)卻很困難，因?yàn)橘?gòu)買感染動(dòng)物或通過(guò)污染的飼料都有可能造成沙門氏菌病暴發(fā)，所以，只有通過(guò)流行病學(xué)調(diào)查，才能更有效地確定感染來(lái)源，真正解決問(wèn)題。
（2）未知或知之甚少病因疾病的調(diào)查與控制。根據(jù)流行病學(xué)觀察，有許多疾病在原因被確定之前能夠得到控制。例如，在病原體被分離鑒定前，美國(guó)學(xué)者通過(guò)傳染病性質(zhì)的評(píng)價(jià)實(shí)現(xiàn)了牛傳染性胸膜肺炎的根除。又如，牛瘟在其病原體被發(fā)現(xiàn)之前，就通過(guò)撲殺政策得到了控制。愛(ài)德華?詹納在18世紀(jì)發(fā)現(xiàn)感染牛痘病毒可以對(duì)人類天花起到免疫保護(hù)作用，而這也是在病毒分離鑒定之前完成的，從而奠定了全球根除天花的基礎(chǔ)。英國(guó)的流行病學(xué)研究表明，牛傳染性海綿狀腦病（瘋牛�。┡c患癢病綿羊的肉和骨粉的添加飼料有關(guān)。盡管當(dāng)時(shí)尚未確定病原體，但立法禁止飼喂反芻動(dòng)物源性蛋白后該疾病得到了控制。
（3）疾病病因和風(fēng)險(xiǎn)因素的研究。為了徹底達(dá)到預(yù)防疾病的目的，必須了解疾病發(fā)生或流行的原因，即流行病學(xué)必須發(fā)掘病因及疾病風(fēng)險(xiǎn)因素。
有些疾病的病因是單一的，如豬瘟病毒引起的豬瘟。有些疾病則不是這樣，非傳染病往往由多種因素綜合作用而發(fā)生，如高血壓、高血脂、吸煙、少活動(dòng)、肥胖等，這些