《長江三峽水利樞紐過閘船舶安全自查指南》共11章，分別為*章船舶證書，第二章船舶文書，第三章船舶配員及船員證書，第四章船舶主要設施設備，第五章船舶配載及貨物積載、系固和隔離，第六章船舶應急管理、應急預案及演練，第七章載運危險物品船舶特殊要求，第八章船員、乘客及貨物登記與安全自查記錄，第九章船舶過閘申報，第十章防污染的結構設備及管理，第十一章船舶過閘常見缺陷分析及安全警示案例。