《基因工程實驗項目化教程》為“十三五”江蘇省高等學(xué)校重點教材。全書選取L-天冬酰胺酶Ⅱ為目標(biāo)產(chǎn)品,以大腸桿菌L-天冬酰胺酶Ⅱ基因(ansB)的克隆和表達為主線,按照基因工程的操作流程將相關(guān)知識和技能分解為前后連貫的9個項目、34項任務(wù),涉及的內(nèi)容主要包括核酸分離純化、聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)、DNA體外重組、重組子篩選和鑒定、基因誘導(dǎo)表達與產(chǎn)物分析、瓊脂糖和聚丙烯酰胺凝膠電泳以及基因工程實驗安全與防護等。本書突出知識、技能和素質(zhì)的同步提升,深入淺出,圖文并茂,適合項目載體、任務(wù)驅(qū)動、學(xué)生主體的行動導(dǎo)向教學(xué)。
本書可供職業(yè)本科、應(yīng)用型本科院校生物科學(xué)類、生物工程類、藥學(xué)類專業(yè)使用,也可供高職高專生物技術(shù)類、制藥技術(shù)類等相關(guān)專業(yè)使用,還可以作為相關(guān)企事業(yè)單位參考用書。
項目一基因工程實驗安全及防護 001
【學(xué)習(xí)目標(biāo)】 001
【項目說明】 001
【基礎(chǔ)知識】 001
(一)基因工程概述 001
(二)基因工程實驗安全及生物安全操作規(guī)范 005
【項目實施】 010
任務(wù)1-1基因工程實驗常用的有毒化學(xué)試劑及其防護 010
任務(wù)1-2掌握基因工程實驗常見儀器設(shè)備的操作規(guī)程和注意事項 014
任務(wù)1-3基因工程實驗生物危害廢品的處理 019
【能力拓展】 021
(一)火災(zāi)及預(yù)防 021
(二)觸電及急救 026
【實踐練習(xí)】 032
項目二基因工程實驗常用溶液及培養(yǎng)基配制 034
【學(xué)習(xí)目標(biāo)】 034
【項目說明】 034
【基礎(chǔ)知識】 034
(一)化學(xué)試劑的規(guī)格和生物試劑的分類 034
(二)溶液濃度的表示、調(diào)整和互換 036
(三)溶液的配制 038
(四)生物實驗室玻璃器皿的洗滌 042
【項目實施】 044
任務(wù)2-1移液器的使用與維護 044
任務(wù)2-2配制常用溶液和抗生素 048
任務(wù)2-3常用細(xì)菌培養(yǎng)基及配制 052
【能力拓展】 055
(一)常用酵母培養(yǎng)基 055
(二)試劑盒 057
(三)體外診斷試劑 059
【實踐練習(xí)】 062
項目三大腸桿菌基因組DNA的制備 063
【學(xué)習(xí)目標(biāo)】 063
【項目說明】 063
【基礎(chǔ)知識】 063
(一)核酸的理化性質(zhì) 063
(二)核酸的分離提取原理 067
(三)核酸的固相提取方法 071
【項目實施】 073
任務(wù)3-1制備大腸桿菌基因組DNA的操作準(zhǔn)備 073
任務(wù)3-2SDS法制備大腸桿菌基因組DNA 076
任務(wù)3-3CTAB法制備大腸桿菌基因組DNA 079
任務(wù)3-4煮沸法制備大腸桿菌基因組DNA 082
【能力拓展】 083
(一)動物基因組DNA的提取 083
(二)植物基因組DNA的提取 085
(三)酵母基因組DNA的提取 085
(四)總RNA和mRNA的提取 086
【實踐練習(xí)】 088
項目四PCR擴增大腸桿菌L-天冬酰胺酶Ⅱ基因(ansB) 089
【學(xué)習(xí)目標(biāo)】 089
【項目說明】 089
【基礎(chǔ)知識】 090
(一)目的基因的分離制備 090
(二)聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng) 092
(三)PCR引物設(shè)計 095
(四)降落PCR 100
(五)PCR技術(shù)的應(yīng)用 101
【項目實施】 101
任務(wù)4-1操作準(zhǔn)備 101
任務(wù)4-2L-天冬酰胺酶Ⅱ基因(ansB)引物設(shè)計 106
任務(wù)4-3PCR擴增L-天冬酰胺酶Ⅱ基因(ansB) 110
任務(wù)4-4降落PCR優(yōu)化L-天冬酰胺酶Ⅱ基因(ansB)擴增退火溫度 112
【能力拓展】 114
(一)實時熒光定量PCR 114
(二)菌落PCR 122
(三)常用核酸序列數(shù)據(jù)庫 123
【實踐練習(xí)】 125
項目五質(zhì)粒pET-28a的制備 126
【學(xué)習(xí)目標(biāo)】 126
【項目說明】 126
【基礎(chǔ)知識】 126
(一)質(zhì)粒 127
(二)pET系列質(zhì)粒 130
(三)質(zhì)粒DNA的提取方法 132
(四)瓊脂糖電泳鑒定質(zhì)粒DNA 134
(五)質(zhì)粒DNA濃度和純度檢測 135
【項目實施】 135
任務(wù)5-1操作準(zhǔn)備 135
任務(wù)5-2SDS堿裂解法小量制備質(zhì)粒pET-28a 137
任務(wù)5-3SDS堿裂解法大量制備質(zhì)粒pET-28a 141
任務(wù)5-4少量提取質(zhì)粒pET-28a的簡易方法 142
任務(wù)5-5煮沸裂解法快速提取質(zhì)粒pET-28a 144
【能力拓展】 145
(一)酵母表達載體 145
(二)質(zhì)粒圖譜的繪制 147
(三)質(zhì)粒資源的獲取方式 151
【實踐練習(xí)】 155
項目六瓊脂糖凝膠電泳檢測基因組DNA、PCR產(chǎn)物及質(zhì)粒pET-28a 157
【學(xué)習(xí)目標(biāo)】 157
【項目說明】 157
【基礎(chǔ)知識】 157
(一)電泳 157
(二)瓊脂糖凝膠電泳 158
(三)核酸電泳的指示劑與染色劑 161
(四)核酸電泳的DNA分子量標(biāo)記 163
【項目實施】 165
任務(wù)6-1操作準(zhǔn)備 165
任務(wù)6-2瓊脂糖凝膠電泳檢測基因組DNA、質(zhì)粒pET-28a及PCR產(chǎn)物 166
任務(wù)6-3PCR擴增產(chǎn)物的純化回收 172
【能力拓展】 174
(一)新型核酸熒光染料 174
(二)脈沖場凝膠電泳 177
(三)雙相電泳 179
(四)微型凝膠電泳 180
【實踐練習(xí)】 181
項目七L-天冬酰胺酶Ⅱ基因(ansB)和質(zhì)粒pET-28a的酶切與連接 182
【學(xué)習(xí)目標(biāo)】 182
【項目說明】 182
【基礎(chǔ)知識】 182
(一)核酸工具酶及主要功能 182
(二)限制性內(nèi)切核酸酶 183
(三)DNA連接酶 186
(四)重組DNA分子的構(gòu)建 188
【項目實施】 188
任務(wù)7-1操作準(zhǔn)備 188
任務(wù)7-2目的基因ansB和質(zhì)粒pET-28a的雙酶切 189
任務(wù)7-3目的基因ansB和質(zhì)粒pET-28a酶切產(chǎn)物的檢測、純化和回收 191
任務(wù)7-4目的基因ansB和質(zhì)粒pET-28a的連接 193
【能力拓展】 195
(一)DNA甲基化酶及其它工具酶 195
(二)Ⅱ型限制性內(nèi)切核酸酶的幾種特殊類型 196
(三)目的基因片段與載體分子的連接方法 197
(四)末端轉(zhuǎn)換常用的方法和使用的主要工具酶 198
【實踐練習(xí)】 199
項目八將重組質(zhì)粒pET-28a-ansB轉(zhuǎn)化至大腸桿菌BL21 200
【學(xué)習(xí)目標(biāo)】 200
【項目說明】 200
【基礎(chǔ)知識】 201
(一)細(xì)菌自然轉(zhuǎn)化 201
(二)重組 DNA分子的轉(zhuǎn)化 203
(三)受體細(xì)胞與感受態(tài) 205
【項目實施】 206
任務(wù)8-1操作準(zhǔn)備 206
任務(wù)8-2大腸桿菌BL21感受態(tài)細(xì)胞的制備 208
任務(wù)8-3用熱激法將重組質(zhì)粒pET-28a-ansB導(dǎo)入大腸桿菌BL21 210
任務(wù)8-4用電穿孔法將重組質(zhì)粒pET-28a-ansB導(dǎo)入大腸桿菌BL21 212
【能力拓展】 214
(一)重組DNA轉(zhuǎn)化至酵母的方法 214
(二)重組DNA轉(zhuǎn)化至動物細(xì)胞的方法 215
(三)轉(zhuǎn)基因技術(shù) 217
【實踐練習(xí)】 219
項目九重組子的鑒定及ansB基因表達產(chǎn)物分析 220
【學(xué)習(xí)目標(biāo)】 220
【項目說明】 220
【基礎(chǔ)知識】 220
(一)重組子的篩選與鑒定 220
(二)目的基因在宿主細(xì)胞中的表達 224
(三)基因表達產(chǎn)物的電泳分析及酶活檢測 226
【項目實施】 229
任務(wù)9-1操作準(zhǔn)備 229
任務(wù)9-2重組菌中ansB基因的誘導(dǎo)表達和粗提取 231
任務(wù)9-3基因表達產(chǎn)物的SDS-PAGE檢測 232
任務(wù)9-4基因表達產(chǎn)物的酶活檢測 235
【能力拓展】 236
(一)蛋白質(zhì)工程 236
(二)大腸桿菌L-天冬酰胺酶Ⅱ的結(jié)構(gòu)與改造 238
(三)重組菌L-天冬酰胺酶Ⅱ的純化策略 241
【實踐練習(xí)】 242
參考文獻 244