《基礎生物信息學分析實踐教程》從初學者及應用的角度對生物信息學分析所涉及的幾個方面進行了介紹,提供了一些重要的常用軟件的基本性能、獲取方法和簡單的使用步驟,力圖通過簡單直觀的方式使初學者能在短的時間內(nèi)了解生物信息學軟件的基本功能,而不著眼于對軟件功能以及所涉及算法的全面介紹。全書共分為四章,從計算機基礎知識入手,以核酸和蛋白質(zhì)序列分析為重點,由淺入深地介紹涉及核酸與蛋白質(zhì)序列分析與研究的各個方面。
章 美國國家生物技術(shù)信息中心(NCBI)網(wǎng)站相關(guān)應用
第二章 BLAST同源序列比對
第三章 多序列比對及其功能域預測
第四章 系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建
第五章 PCR引物設計及評價
第六章 熒光定量PCR分析基因表達量
第七章 基因預測分析
第八章 RNA二級結(jié)構(gòu)分析
第九章 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分析及結(jié)構(gòu)預測
第十章 GO分析基因功能
第十一章 KEGG等代謝通路專業(yè)數(shù)據(jù)庫
第十二章 作物專屬基因組數(shù)據(jù)庫及其應用
第十三章 Linux系統(tǒng)入門及編程基礎
第十四章 基因組重頭拼接
第十五章 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)從頭拼接
第十六章 全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS).
參考文獻