陳天祥作《四書辨疑》，被時人認為是質疑朱學之作。陳氏此書，所質疑者不惟《集注》一書而已，亦有對經文本身的疑問和對前人注解的指摘。持論公允，摒除門戶之見。雖質疑朱子之失，亦肯定朱子之得。故四庫館臣論此書曰“大意主于闕疑而不貴穿鑿”“實非有意立異規(guī)為門戶之爭者”，評價此書無害于朱熹《四書章句集注》，可并存相參。應該說，《四書辨疑》是以朱熹《集注》為依托而延展開去對經文的探究，其目的不是要貶抑朱學，而是力圖匡正朱學，使其更加符合經文旨意。