目錄
第一部分 癌癥的基本原理
第一章 癌癥基因組 1
引言 1
癌癥基因和突變 1
癌基因的鑒定 2
通過癌癥基因組分析檢測體細胞變異類型 12
癌癥基因組分析中的信號通路導向模型 15
癌癥基因組計劃網絡 20
癌癥基因組全景圖 20
癌癥基因組的綜合分析 21
癌癥基因組與腫瘤的新分類 23
癌癥基因組學與耐藥性 25
癌癥基因組分析的展望 27
致謝 28
第二章 癌癥的標志性特征：癌癥醫(yī)學遵循的法則 37
引言 37
本質上的標志性能力 38
兩個普遍的特性協(xié)助標志性特征的獲得 54
構成腫瘤微環(huán)境的細胞類型 56
癌癥標志性特征的靶向治療 65
結論和對未來的展望 67
致謝 68
第三章 腫瘤分子檢測方法 78
分子診斷在腫瘤研究中的應用 78
臨床分子診斷實驗室：原則和法規(guī) 83
分子診斷的樣本要求 84
分子診斷的檢測過程 84
技術 86
第四章 致瘤病毒 104
腫瘤病毒學原理 104
乳頭狀瘤病毒 107
多瘤病毒 110
EB 病毒 112
Kaposi 肉瘤皰疹病毒 115
動物和人類反轉錄病毒 117
肝炎病毒 120
結論 124
第五章 炎癥 132
引言 132
炎癥的分子基礎 133
炎癥在細胞轉化中的作用 133
炎癥在細胞存活中的作用 134
炎癥在細胞增殖中的作用 135
炎癥在細胞侵襲中的作用 135
炎癥在血管生成中的作用 136
炎癥在腫瘤轉移中的作用 137
表觀遺傳學改變和炎癥 138
炎癥在腫瘤診斷中的作用 138
炎癥和轉化醫(yī)學 139
結論 139
第六章 抗腫瘤藥物——激酶抑制劑 146
引言 146
早期的成功：靶向已知激酶突變的癌癥 147
直接靶向PI3K 通路 160
激酶抑制劑的組合誘導反應和預防抵抗性 160
對未來的思考：激酶抑制劑在癌癥醫(yī)學中的作用 161
第七章 抗血管生成制劑 168
引言 168
血管生成過程 168
血管生成抑制劑的藥物開發(fā) 170
已批準的抗血管生成藥物在腫瘤治療中的臨床應用 174
聯合治療 181
抗血管生成療法的生物標志物 182
抗血管生成治療的治療抵抗 183
第二部分 各種癌癥的分子生物學
第八章 頭頸部腫瘤的分子生物學 192
引言 192
頭頸部鱗狀細胞癌的分子機制 195
癌癥基因組圖譜計劃 196
癌癥干細胞 198
第九章 肺癌的分子生物學 203
引言 203
肺癌的易感性：遺傳易感性和煙草中的致癌物 204
癌前病變的分子變異 205
肺癌中的遺傳和表觀遺傳變化 205
原癌基因、生長因子通路和生長因子靶向治療 207
肺癌的基因組分析技術 210
表觀遺傳學/ 表觀基因組學 212
抑癌基因和生長抑制 212
細胞周期蛋白和細胞周期調控通路 213
LKB1、AMPK 和mTOR 信號通路 214
其他公認的抑癌基因 215
肺癌中其他生物學異常 216
miRNA 在肺癌診斷和治療中的作用 217
肺癌miRNA 譜 218
侵襲、轉移和血管生成 221
癌癥干細胞假說 221
肺癌臨床的分子工具 222
第十章 食管癌和胃癌的分子生物學 236
引言 236
食管癌的分子生物學 236
胃癌的分子生物學 240
第十一章 胰腺癌的分子生物學 247
引言 247
常見的分子改變 248
第十二章 肝癌的分子生物學 261
引言 261
肝癌的遺傳學改變 262
肝癌的表觀遺傳學改變 263
肝癌遺傳學改變的突變圖譜：新一代 264
肝癌微環(huán)境 266
肝細胞癌的分類和預后預測 267
結論和展望 268
第十三章 結直腸癌的分子生物學 273
引言 273
結直腸癌多階段模型 273
癌癥風險增高的遺傳性綜合征強調了結直腸癌發(fā)生的早期事件和關鍵通路 276
結直腸癌的發(fā)生和進展的整合模型 288
結論 289
第十四章 腎癌的分子生物學 298
引言 298
VHL 病 298
遺傳性乳頭狀腎細胞癌1 型 301
Xp11.2 易位腎細胞癌 301
Birt-Hogg-Dubé 綜合征 302
遺傳性平滑肌瘤病和腎細胞癌 303
家族性腎癌：琥珀酸脫氫酶基因 306
結節(jié)性硬化癥 306
結論 307
第十五章 膀胱癌的分子生物學 315
引言 315
非浸潤階段尿路上皮癌的關鍵分子改變 315
浸潤性尿路上皮癌的關鍵分子改變 321
外顯子組的測序信息 326
表觀遺傳學改變 327
來自表達譜的信息 327
尿路上皮腫瘤起始細胞 328
分子發(fā)病機制和腫瘤克隆 328
多腫瘤亞組定義的分子表達譜 329
致謝 331
第十六章 前列腺癌的分子生物學 344
引言 344
前列腺癌的基因組全景概述 344
雄激素受體生物學和治療 346
疾病進展期間其他經常被改變的通路 348
E26 轉化特異性基因融合與前列腺癌分子亞型 349
前列腺癌生物學和治療的新興領域 351
第十七章 婦科癌癥的分子生物學 360
引言 360
卵巢癌 360
子宮內膜癌 368
子宮頸、陰道和外陰癌 370
第十八章 乳腺癌的分子生物學 376
引言 376
乳腺癌的遺傳學 376
遺傳性乳腺癌 377
乳腺癌的體細胞改變 381
乳腺癌的轉錄譜 382
乳腺癌的表觀遺傳學 386
蛋白質/ 通路的改變 387
雌激素受體途徑 387
結論 391
第十九章 內分泌腫瘤的分子生物學 396
引言 396
多發(fā)性內分泌腫瘤綜合征 396
分子遺傳學在臨床醫(yī)學中的應用 404
甲狀腺癌 404
未來研究方向 407
第二十章 肉瘤的分子生物學 413
引言 413
染色體易位相關的軟組織肉瘤 418
與突變相關的簡單核型軟組織肉瘤 422
復雜軟組織肉瘤類型 423
軟骨腫瘤 427
骨肉瘤 429
未來的發(fā)展：新一代測序和功能篩選 430
第二十一章 皮膚黑色素瘤的分子生物學 444
引言 444
RAS-RAF-MAPK 通路 445
MAPK 通路和治療抵抗 450
黑色素合成途徑 454
黑色素瘤的分子遺傳學：展望未來 456
第二十二章 中樞神經系統(tǒng)腫瘤的分子生物學 464
膠質瘤 464
腦膜瘤 470
髓母細胞瘤 472
室管膜瘤 474
結論 475
第二十三章 兒童癌癥的分子生物學 479
引言 479
抑癌基因 481
視網膜母細胞瘤：范例 482
琥珀酸脫氫酶缺陷的胃腸道間質瘤 483
神經纖維瘤 483
神經母細胞瘤 484
尤因肉瘤家族腫瘤 485
橫紋肌肉瘤 486
兒童Li-Fraumeni 綜合征腫瘤相關的遺傳性綜合征 487
惡性橫紋肌樣瘤 489
DICER1 綜合征 489
生殖細胞突變和兒童癌癥的預測性檢測 490
分子治療 490
第二十四章 淋巴瘤的分子生物學 498
引言 498
淋巴瘤的起源細胞 498
淋巴瘤遺傳病變的普遍機制 501
B 細胞非霍奇金淋巴瘤的分子發(fā)病機制 505
T 細胞非霍奇金淋巴瘤的分子發(fā)病機制 517
霍奇金淋巴瘤的分子發(fā)病機制 520
第二十五章 急性白血病的分子生物學 538
引言 538
白血病干細胞 541
急性白血病中的遺傳學事件 542
以核心結合因子為靶標的染色體易位 543
以維甲酸受體α 為靶標的染色體易位 544
靶向HOX 家族成員的突變 545
靶向MLL 基因的染色體易位 546
C/EBPα 突變 547
GATA-1 突變 548
與小兒急性巨核細胞白血病相關的t（1；22）易位 548
表觀修飾因子的突變 548
導致c-MYC 基因過表達的染色體易位 550
與T 細胞受體相關的染色體易位 550
急性白血病中的點突變 550
抑癌基因突變 552
NOTCH 的激活突變 553
改變NPM1 定位的突變 554
急性淋巴性白血病淋巴發(fā)育基因的突變 554
急性白血病的突變互補群 555
結論 556
第二十六章 慢性白血病的分子生物學 566
引言 566
慢性粒細胞白血病 566
慢性淋巴細胞白血病 571
第三部分 遺傳咨詢
第二十七章 遺傳咨詢 583
引言 583
腫瘤遺傳咨詢的候選者 584
腫瘤遺傳咨詢的不同階段 585
腫瘤遺傳咨詢存在的問題 591
近期進展和未來方向 594
第二十八章 乳腺癌的遺傳檢測 600
引言 600
乳腺癌高風險人群鑒別 600
基因檢測 600
BRCA1 和BRCA2 601
TP53 604
Cowden 綜合征 606
其他遺傳突變和乳腺癌 609
中和低外顯率乳腺癌易感基因 610
結論 611
第二十九章 卵巢癌的遺傳檢測 619
引言 619
遺傳性乳腺癌和卵巢癌綜合征——BRCA1 和BRCA2 基因 620
Lynch 綜合征 622
新基因 625
結論 626
第三十章 結直腸癌的遺傳檢測（息肉綜合征） 633
引言 633
腺瘤性息肉病 634
錯構瘤性息肉病 638
結論 641
第三十一章 結直腸癌的遺傳檢測（非息肉綜合征） 644
引言 644
臨床分類：Amsterdam 標準和Bethesda 指南 645
腫瘤篩查 646
基因檢測 647
Lynch 綜合征的遺傳咨詢 647
Lynch 綜合征的健康管理 648
致謝 648
第三十二章 子宮癌的遺傳檢測 651
引言 651
Lynch 綜合征 651
磷酸酶和張力蛋白同源性錯構瘤綜合征 653
遺傳性平滑肌瘤和腎細胞癌 653
子宮癌和其他遺傳性腫瘤綜合征 654
結論 655
第三十三章 泌尿道癌的遺傳檢測 659
引言 659
腎細胞癌的遺傳易感性 660
泌尿道上皮癌的遺傳易感性 664
遺傳性檢測的指標 665
遺傳性檢測和咨詢 666
結論 667
第三十四章 胰腺癌的遺傳檢測 670
引言 670
胰腺癌的致病基因 670
增加胰腺癌風險的綜合征 673
經驗風險咨詢和管理 674
第三十五章 胃癌的遺傳檢測 679
引言 679
組織學的定義及描述 679
病因 680
胃癌的流行病學 681
遺傳性彌漫型胃癌的癌癥風險的篩查和管理 684
增加胃癌風險的其他遺傳性癌癥綜合征 685
結論 689
第三十六章 內分泌系統(tǒng)的遺傳檢測 695
引言 695
多發(fā)性內分泌瘤1 型 695
多發(fā)性內分泌瘤2 型 697
10 號染色體磷酸酶和張力蛋白同源等位基因 699
SDHX/TMEM127/MAX 701
VHL 病和嗜鉻細胞瘤 702
第三十七章 皮膚癌的遺傳檢測 709
引言 709
遺傳咨詢 710
遺傳性皮膚癌和神經纖維瘤病 710
結論 721